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Showing metabocard for Pyridoxine 5'-phosphate (HMDB0001319)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2005-11-16 15:48:42 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2019-01-11 19:15:50 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0001319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Pyridoxine 5'-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Pyridoxine 5'-phosphate is a substrate for Pyridoxine-5'-phosphate oxidase and Pyridoxal kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C8H12NO6P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 249.1577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 249.040223633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[5-hydroxy-4-(hydroxymethyl)-6-methylpyridin-3-yl]methoxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | pyridoxine-5'-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 447-05-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC1=NC=C(COP(O)(O)=O)C(CO)=C1O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C8H12NO6P/c1-5-8(11)7(3-10)6(2-9-5)4-15-16(12,13)14/h2,10-11H,3-4H2,1H3,(H2,12,13,14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | WHOMFKWHIQZTHY-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | This compound belongs to the class of organic compounds known as pyridoxine-5'-phosphates. These are pyridoxines that carry a phosphate group at the 5-position. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organoheterocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Pyridines and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pyridoxines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pyridoxine-5'-phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Spectra |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations |
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Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References |
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Associated OMIM IDs |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | DB02209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FoodDB ID | FDB022552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | C00007505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 1026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | PYRIDOXINE-5P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | 35527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 6156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 1055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | PXP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 28803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Argoudelis, Chris J. Preparation of crystalline pyridoxine 5'-phosphate and some of its properties. Journal of Agricultural and Food Chemistry (1986), 34(6), 995-8. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Enzymes
- General function:
- Involved in pyridoxamine-phosphate oxidase activity
- Specific function:
- Catalyzes the oxidation of either pyridoxine 5'-phosphate (PNP) or pyridoxamine 5'-phosphate (PMP) into pyridoxal 5'-phosphate (PLP).
- Gene Name:
- PNPO
- Uniprot ID:
- Q9NVS9
- Molecular weight:
- 29987.79
Reactions
Pyridoxine 5'-phosphate + Oxygen → Pyridoxal 5'-phosphate + Hydrogen peroxide | details |
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Protein serine phosphatase that dephosphorylates 'Ser-3' in cofilin and probably also dephosphorylates phospho-serine residues in DSTN. Regulates cofilin-dependent actin cytoskeleton reorganization. Required for normal progress through mitosis and normal cytokinesis. Does not dephosphorylate phospho-threonines in LIMK1. Does not dephosphorylate peptides containing phospho-tyrosine. Pyridoxal phosphate phosphatase. Has some activity towards pyridoxal 5'-phosphate (PLP), pyridoxine 5'-phosphate (PMP) and pyridoxine 5'-phosphate (PNP), with a highest activity with PLP followed by PNP.
- Gene Name:
- PDXP
- Uniprot ID:
- Q96GD0
- Molecular weight:
- 31697.735
Reactions
Pyridoxine + Phosphoric acid → Pyridoxine 5'-phosphate + Water | details |
- General function:
- Involved in phosphatase activity
- Specific function:
- Phosphatase that has high activity toward pyridoxal 5'-phosphate (PLP). Also active at much lower level toward pyrophosphate, phosphoethanolamine (PEA), phosphocholine (PCho), phospho-l-tyrosine, fructose-6-phosphate, p-nitrophenyl phosphate, and h-glycerophosphate.
- Gene Name:
- PHOSPHO2
- Uniprot ID:
- Q8TCD6
- Molecular weight:
- 27768.72
Reactions
Pyridoxine + Phosphoric acid → Pyridoxine 5'-phosphate + Water | details |