Showing metabocard for Difucosyllacto-N-hexaose I (HMDB0005823)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Expected but not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2007-04-12 13:26:51 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2021-09-14 15:18:02 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0005823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Difucosyllacto-N-hexaose I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Difucosyllacto-N-hexaose I is an oligosaccharide characterized in breast milk and found in feces of breast-fed infants. The oligosaccharides profile in the feces is similar to that of the ingested milk. Approximately 40% to 50% of the total ingested oligosaccharides can be found in feces of breast-fed infants. Oligosaccharides in human milk represent a group of bioactive molecules that have evolved to be an abundant and diverse component of human milk, even though they have no direct nutritive value to the infant. A recent hypothesis proposes that they could be substrates for the development of the intestinal microflora and the mucosal immune system. (PMID: 11787695 , 14530096 , 17002410 ). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | MOL for HMDB0005823 (Difucosyllacto-N-hexaose I)Mrv0541 02231220302D 93 99 0 0 0 0 999 V2000 15.9764 -7.0541 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18.8343 -7.0541 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14.5474 -8.7042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19.5489 -8.2917 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14.5474 -6.2291 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16.6909 -8.2917 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.1184 -8.7042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21.6923 -7.0541 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21.6923 -8.7042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17.4054 -6.2291 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.3099 -5.5145 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18.8343 -8.7042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22.9298 -7.7686 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.1184 -11.1792 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20.9778 -9.9417 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11.6895 -11.1792 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15.9764 -9.5292 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14.5474 -9.5292 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11.6895 -9.5292 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19.5489 -9.9417 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15.3725 -4.8002 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22.5173 -5.6252 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18.1199 -9.9417 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23.1213 -9.5292 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14.5474 -3.3711 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.1674 -5.6252 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12.8974 -3.3711 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23.1213 -11.1792 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.9924 -7.0541 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21.6923 -12.0042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14.5474 -12.0042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12.4040 -8.2917 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21.6923 -6.2291 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10.2605 -12.0042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.1184 -12.0042 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11.6895 -13.6542 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.1184 -13.6542 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10.2605 -14.4793 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13.1184 -7.0541 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RDKit 3D
Difucosyllacto-N-hexaose I
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4.4176 1.7874 2.6886 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6087 -0.3508 1.9632 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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11.2334 2.6158 -2.2475 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11.4401 1.2750 -2.7429 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.9614 3.4716 -3.4487 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12.0675 3.4262 -4.3386 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
9.9807 3.8707 -0.5002 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
9.4755 4.8199 -1.4260 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.9958 4.4622 0.3563 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11.5141 3.6089 1.3618 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12.0412 5.3144 -0.1687 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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60 18 56 66 CONECT 61 19 56 68 CONECT 62 9 15 69 CONECT 63 20 53 CONECT 64 21 57 70 CONECT 65 22 59 71 CONECT 66 14 60 81 CONECT 67 23 55 CONECT 68 14 16 61 CONECT 69 24 62 74 CONECT 70 25 64 72 CONECT 71 26 65 75 CONECT 72 27 70 73 CONECT 73 11 72 82 CONECT 74 28 69 77 CONECT 75 29 71 76 CONECT 76 13 75 83 CONECT 77 30 74 78 CONECT 78 15 77 85 CONECT 79 32 39 86 CONECT 80 33 40 87 CONECT 81 31 66 CONECT 82 73 CONECT 83 76 93 CONECT 84 16 88 89 CONECT 85 78 CONECT 86 79 CONECT 87 80 CONECT 88 34 84 90 CONECT 89 35 84 91 CONECT 90 36 88 92 CONECT 91 37 89 CONECT 92 38 90 CONECT 93 83 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 93 0 198 0 END 3D PDB for HMDB0005823 (Difucosyllacto-N-hexaose I)COMPND HMDB0005823 HETATM 1 C1 UNL 1 5.870 0.433 4.002 1.00 0.00 C HETATM 2 C2 UNL 1 4.951 0.690 2.896 1.00 0.00 C HETATM 3 O1 UNL 1 4.418 1.787 2.689 1.00 0.00 O HETATM 4 N1 UNL 1 4.609 -0.351 1.963 1.00 0.00 N HETATM 5 C3 UNL 1 3.752 -0.264 0.855 1.00 0.00 C HETATM 6 C4 UNL 1 4.323 0.155 -0.478 1.00 0.00 C HETATM 7 O2 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HETATM 27 O11 UNL 1 13.023 5.528 0.547 1.00 0.00 O HETATM 28 C16 UNL 1 7.378 0.306 -1.847 1.00 0.00 C HETATM 29 O12 UNL 1 6.632 1.272 -2.514 1.00 0.00 O HETATM 30 O13 UNL 1 3.391 0.464 -1.382 1.00 0.00 O HETATM 31 C17 UNL 1 2.356 -0.368 -1.514 1.00 0.00 C HETATM 32 C18 UNL 1 2.617 -1.208 -2.799 1.00 0.00 C HETATM 33 O14 UNL 1 3.778 -1.954 -2.668 1.00 0.00 O HETATM 34 C19 UNL 1 1.914 -1.291 -0.449 1.00 0.00 C HETATM 35 O15 UNL 1 0.622 -0.880 -0.001 1.00 0.00 O HETATM 36 C20 UNL 1 -0.397 -1.672 -0.477 1.00 0.00 C HETATM 37 O16 UNL 1 -0.522 -2.726 0.450 1.00 0.00 O HETATM 38 C21 UNL 1 -1.552 -3.561 0.222 1.00 0.00 C HETATM 39 C22 UNL 1 -1.165 -4.617 -0.799 1.00 0.00 C HETATM 40 O17 UNL 1 -0.857 -4.106 -2.044 1.00 0.00 O HETATM 41 C23 UNL 1 -2.889 -3.028 -0.051 1.00 0.00 C HETATM 42 O18 UNL 1 -3.701 -3.166 1.123 1.00 0.00 O HETATM 43 C24 UNL 1 -2.916 -1.650 -0.556 1.00 0.00 C HETATM 44 O19 UNL 1 -3.824 -0.976 0.320 1.00 0.00 O HETATM 45 C25 UNL 1 -4.877 -0.479 -0.343 1.00 0.00 C HETATM 46 O20 UNL 1 -5.840 -1.612 -0.413 1.00 0.00 O HETATM 47 C26 UNL 1 -6.607 -1.317 -1.551 1.00 0.00 C HETATM 48 C27 UNL 1 -7.349 -2.517 -2.001 1.00 0.00 C HETATM 49 O21 UNL 1 -6.508 -3.581 -2.367 1.00 0.00 O HETATM 50 C28 UNL 1 -7.429 -0.096 -1.356 1.00 0.00 C HETATM 51 O22 UNL 1 -8.413 -0.489 -0.397 1.00 0.00 O HETATM 52 C29 UNL 1 -9.699 -0.434 -0.792 1.00 0.00 C HETATM 53 O23 UNL 1 -10.377 -1.656 -0.634 1.00 0.00 O HETATM 54 C30 UNL 1 -10.641 -1.976 0.683 1.00 0.00 C HETATM 55 C31 UNL 1 -9.437 -2.189 1.547 1.00 0.00 C HETATM 56 C32 UNL 1 -11.597 -1.023 1.340 1.00 0.00 C HETATM 57 O24 UNL 1 -12.829 -1.623 1.603 1.00 0.00 O HETATM 58 C33 UNL 1 -11.821 0.106 0.358 1.00 0.00 C HETATM 59 O25 UNL 1 -12.442 -0.427 -0.769 1.00 0.00 O HETATM 60 C34 UNL 1 -10.424 0.643 0.036 1.00 0.00 C HETATM 61 O26 UNL 1 -10.460 1.858 -0.606 1.00 0.00 O HETATM 62 C35 UNL 1 -6.719 1.028 -0.662 1.00 0.00 C HETATM 63 O27 UNL 1 -6.051 1.885 -1.472 1.00 0.00 O HETATM 64 C36 UNL 1 -6.662 3.100 -1.670 1.00 0.00 C HETATM 65 O28 UNL 1 -6.050 4.156 -0.985 1.00 0.00 O HETATM 66 C37 UNL 1 -7.037 5.090 -0.668 1.00 0.00 C HETATM 67 C38 UNL 1 -6.541 6.212 0.213 1.00 0.00 C HETATM 68 O29 UNL 1 -5.514 6.931 -0.454 1.00 0.00 O HETATM 69 C39 UNL 1 -7.737 5.589 -1.893 1.00 0.00 C HETATM 70 O30 UNL 1 -9.143 5.606 -1.700 1.00 0.00 O HETATM 71 C40 UNL 1 -7.328 4.927 -3.158 1.00 0.00 C HETATM 72 O31 UNL 1 -6.441 5.745 -3.907 1.00 0.00 O HETATM 73 C41 UNL 1 -6.856 3.521 -3.091 1.00 0.00 C HETATM 74 O32 UNL 1 -5.566 3.480 -3.687 1.00 0.00 O HETATM 75 C42 UNL 1 -5.654 0.553 0.343 1.00 0.00 C HETATM 76 N2 UNL 1 -6.287 0.089 1.550 1.00 0.00 N HETATM 77 C43 UNL 1 -6.265 0.922 2.697 1.00 0.00 C HETATM 78 C44 UNL 1 -6.921 0.452 3.953 1.00 0.00 C HETATM 79 O33 UNL 1 -5.702 2.030 2.636 1.00 0.00 O HETATM 80 C45 UNL 1 -1.638 -0.949 -0.672 1.00 0.00 C HETATM 81 O34 UNL 1 -1.673 0.097 0.313 1.00 0.00 O HETATM 82 C46 UNL 1 2.800 -1.401 0.764 1.00 0.00 C HETATM 83 O35 UNL 1 3.217 -2.628 1.175 1.00 0.00 O HETATM 84 C47 UNL 1 2.713 -3.107 2.342 1.00 0.00 C HETATM 85 O36 UNL 1 3.585 -3.129 3.433 1.00 0.00 O HETATM 86 C48 UNL 1 4.687 -3.920 3.202 1.00 0.00 C HETATM 87 C49 UNL 1 5.556 -3.910 4.434 1.00 0.00 C HETATM 88 C50 UNL 1 4.287 -5.355 2.920 1.00 0.00 C HETATM 89 O37 UNL 1 4.465 -5.587 1.554 1.00 0.00 O HETATM 90 C51 UNL 1 2.763 -5.470 3.134 1.00 0.00 C HETATM 91 O38 UNL 1 2.348 -6.755 2.866 1.00 0.00 O HETATM 92 C52 UNL 1 2.141 -4.456 2.167 1.00 0.00 C HETATM 93 O39 UNL 1 2.281 -4.937 0.854 1.00 0.00 O HETATM 94 H1 UNL 1 6.440 -0.513 3.759 1.00 0.00 H HETATM 95 H2 UNL 1 5.373 0.428 4.972 1.00 0.00 H HETATM 96 H3 UNL 1 6.631 1.250 4.015 1.00 0.00 H HETATM 97 H4 UNL 1 5.046 -1.266 2.184 1.00 0.00 H HETATM 98 H5 UNL 1 3.158 0.723 1.119 1.00 0.00 H HETATM 99 H6 UNL 1 4.876 1.139 -0.217 1.00 0.00 H HETATM 100 H7 UNL 1 6.433 0.743 -0.069 1.00 0.00 H HETATM 101 H8 UNL 1 8.480 -1.361 -0.539 1.00 0.00 H HETATM 102 H9 UNL 1 6.268 -2.385 0.492 1.00 0.00 H HETATM 103 H10 UNL 1 7.598 0.257 1.820 1.00 0.00 H HETATM 104 H11 UNL 1 10.004 0.640 2.098 1.00 0.00 H HETATM 105 H12 UNL 1 10.390 -0.334 0.680 1.00 0.00 H HETATM 106 H13 UNL 1 9.390 -2.164 1.654 1.00 0.00 H HETATM 107 H14 UNL 1 9.447 0.304 -0.965 1.00 0.00 H HETATM 108 H15 UNL 1 10.554 1.804 -0.467 1.00 0.00 H HETATM 109 H16 UNL 1 12.244 2.892 -1.875 1.00 0.00 H HETATM 110 H17 UNL 1 11.443 1.278 -3.720 1.00 0.00 H HETATM 111 H18 UNL 1 10.839 4.510 -3.185 1.00 0.00 H HETATM 112 H19 UNL 1 10.086 3.063 -4.029 1.00 0.00 H HETATM 113 H20 UNL 1 12.840 3.114 -3.783 1.00 0.00 H HETATM 114 H21 UNL 1 9.023 3.675 0.144 1.00 0.00 H HETATM 115 H22 UNL 1 8.767 4.371 -1.966 1.00 0.00 H HETATM 116 H23 UNL 1 10.379 5.203 1.042 1.00 0.00 H HETATM 117 H24 UNL 1 10.910 2.811 1.420 1.00 0.00 H HETATM 118 H25 UNL 1 12.015 5.782 -1.172 1.00 0.00 H HETATM 119 H26 UNL 1 7.653 -0.547 -2.489 1.00 0.00 H HETATM 120 H27 UNL 1 6.486 2.010 -1.840 1.00 0.00 H HETATM 121 H28 UNL 1 1.452 0.260 -1.848 1.00 0.00 H HETATM 122 H29 UNL 1 2.733 -0.516 -3.647 1.00 0.00 H HETATM 123 H30 UNL 1 1.709 -1.810 -2.983 1.00 0.00 H HETATM 124 H31 UNL 1 4.445 -1.620 -3.321 1.00 0.00 H HETATM 125 H32 UNL 1 1.712 -2.269 -0.953 1.00 0.00 H HETATM 126 H33 UNL 1 0.002 -2.205 -1.341 1.00 0.00 H HETATM 127 H34 UNL 1 -1.652 -4.192 1.190 1.00 0.00 H HETATM 128 H35 UNL 1 -0.199 -5.099 -0.430 1.00 0.00 H HETATM 129 H36 UNL 1 -1.901 -5.425 -0.784 1.00 0.00 H HETATM 130 H37 UNL 1 -1.677 -3.568 -2.317 1.00 0.00 H HETATM 131 H38 UNL 1 -3.409 -3.743 -0.780 1.00 0.00 H HETATM 132 H39 UNL 1 -3.536 -2.321 1.631 1.00 0.00 H HETATM 133 H40 UNL 1 -3.437 -1.657 -1.588 1.00 0.00 H HETATM 134 H41 UNL 1 -4.643 -0.344 -1.423 1.00 0.00 H HETATM 135 H42 UNL 1 -5.842 -1.076 -2.335 1.00 0.00 H HETATM 136 H43 UNL 1 -8.016 -2.328 -2.899 1.00 0.00 H HETATM 137 H44 UNL 1 -8.049 -2.836 -1.214 1.00 0.00 H HETATM 138 H45 UNL 1 -5.623 -3.361 -1.953 1.00 0.00 H HETATM 139 H46 UNL 1 -7.964 0.197 -2.253 1.00 0.00 H HETATM 140 H47 UNL 1 -9.839 -0.120 -1.829 1.00 0.00 H HETATM 141 H48 UNL 1 -11.159 -2.979 0.641 1.00 0.00 H HETATM 142 H49 UNL 1 -9.062 -1.203 1.884 1.00 0.00 H HETATM 143 H50 UNL 1 -8.601 -2.707 1.084 1.00 0.00 H HETATM 144 H51 UNL 1 -9.727 -2.819 2.442 1.00 0.00 H HETATM 145 H52 UNL 1 -11.169 -0.610 2.276 1.00 0.00 H HETATM 146 H53 UNL 1 -13.170 -2.159 0.858 1.00 0.00 H HETATM 147 H54 UNL 1 -12.428 0.877 0.856 1.00 0.00 H HETATM 148 H55 UNL 1 -12.175 0.129 -1.544 1.00 0.00 H HETATM 149 H56 UNL 1 -9.923 0.799 1.019 1.00 0.00 H HETATM 150 H57 UNL 1 -9.827 2.512 -0.229 1.00 0.00 H HETATM 151 H58 UNL 1 -7.493 1.623 -0.091 1.00 0.00 H HETATM 152 H59 UNL 1 -7.670 2.997 -1.139 1.00 0.00 H HETATM 153 H60 UNL 1 -7.792 4.517 -0.061 1.00 0.00 H HETATM 154 H61 UNL 1 -7.316 6.962 0.440 1.00 0.00 H HETATM 155 H62 UNL 1 -6.183 5.839 1.199 1.00 0.00 H HETATM 156 H63 UNL 1 -4.978 7.383 0.259 1.00 0.00 H HETATM 157 H64 UNL 1 -7.470 6.678 -2.004 1.00 0.00 H HETATM 158 H65 UNL 1 -9.214 5.863 -0.717 1.00 0.00 H HETATM 159 H66 UNL 1 -8.255 4.918 -3.822 1.00 0.00 H HETATM 160 H67 UNL 1 -6.584 6.698 -3.600 1.00 0.00 H HETATM 161 H68 UNL 1 -7.546 2.822 -3.640 1.00 0.00 H HETATM 162 H69 UNL 1 -4.936 2.917 -3.153 1.00 0.00 H HETATM 163 H70 UNL 1 -4.989 1.438 0.566 1.00 0.00 H HETATM 164 H71 UNL 1 -6.749 -0.819 1.619 1.00 0.00 H HETATM 165 H72 UNL 1 -7.573 1.252 4.359 1.00 0.00 H HETATM 166 H73 UNL 1 -6.184 0.132 4.709 1.00 0.00 H HETATM 167 H74 UNL 1 -7.563 -0.447 3.714 1.00 0.00 H HETATM 168 H75 UNL 1 -1.641 -0.340 -1.628 1.00 0.00 H HETATM 169 H76 UNL 1 -1.434 -0.344 1.175 1.00 0.00 H HETATM 170 H77 UNL 1 2.071 -1.148 1.644 1.00 0.00 H HETATM 171 H78 UNL 1 1.888 -2.418 2.720 1.00 0.00 H HETATM 172 H79 UNL 1 5.351 -3.581 2.370 1.00 0.00 H HETATM 173 H80 UNL 1 6.455 -4.570 4.309 1.00 0.00 H HETATM 174 H81 UNL 1 5.960 -2.887 4.655 1.00 0.00 H HETATM 175 H82 UNL 1 5.010 -4.286 5.326 1.00 0.00 H HETATM 176 H83 UNL 1 4.860 -6.071 3.493 1.00 0.00 H HETATM 177 H84 UNL 1 5.425 -5.661 1.323 1.00 0.00 H HETATM 178 H85 UNL 1 2.558 -5.105 4.154 1.00 0.00 H HETATM 179 H86 UNL 1 2.964 -7.082 2.127 1.00 0.00 H HETATM 180 H87 UNL 1 1.034 -4.432 2.341 1.00 0.00 H HETATM 181 H88 UNL 1 2.145 -4.212 0.239 1.00 0.00 H CONECT 1 2 94 95 96 CONECT 2 3 3 4 CONECT 4 5 97 CONECT 5 6 82 98 CONECT 6 7 30 99 CONECT 7 8 CONECT 8 9 28 100 CONECT 9 10 11 101 CONECT 10 102 CONECT 11 12 14 103 CONECT 12 13 104 105 CONECT 13 106 CONECT 14 15 CONECT 15 16 28 107 CONECT 16 17 CONECT 17 18 22 108 CONECT 18 19 20 109 CONECT 19 110 CONECT 20 21 111 112 CONECT 21 113 CONECT 22 23 24 114 CONECT 23 115 CONECT 24 25 26 116 CONECT 25 117 CONECT 26 27 27 118 CONECT 28 29 119 CONECT 29 120 CONECT 30 31 CONECT 31 32 34 121 CONECT 32 33 122 123 CONECT 33 124 CONECT 34 35 82 125 CONECT 35 36 CONECT 36 37 80 126 CONECT 37 38 CONECT 38 39 41 127 CONECT 39 40 128 129 CONECT 40 130 CONECT 41 42 43 131 CONECT 42 132 CONECT 43 44 80 133 CONECT 44 45 CONECT 45 46 75 134 CONECT 46 47 CONECT 47 48 50 135 CONECT 48 49 136 137 CONECT 49 138 CONECT 50 51 62 139 CONECT 51 52 CONECT 52 53 60 140 CONECT 53 54 CONECT 54 55 56 141 CONECT 55 142 143 144 CONECT 56 57 58 145 CONECT 57 146 CONECT 58 59 60 147 CONECT 59 148 CONECT 60 61 149 CONECT 61 150 CONECT 62 63 75 151 CONECT 63 64 CONECT 64 65 73 152 CONECT 65 66 CONECT 66 67 69 153 CONECT 67 68 154 155 CONECT 68 156 CONECT 69 70 71 157 CONECT 70 158 CONECT 71 72 73 159 CONECT 72 160 CONECT 73 74 161 CONECT 74 162 CONECT 75 76 163 CONECT 76 77 164 CONECT 77 78 79 79 CONECT 78 165 166 167 CONECT 80 81 168 CONECT 81 169 CONECT 82 83 170 CONECT 83 84 CONECT 84 85 92 171 CONECT 85 86 CONECT 86 87 88 172 CONECT 87 173 174 175 CONECT 88 89 90 176 CONECT 89 177 CONECT 90 91 92 178 CONECT 91 179 CONECT 92 93 180 CONECT 93 181 END SMILES for HMDB0005823 (Difucosyllacto-N-hexaose I)CC1OC(OC2C(CO)OC(OC3C(O)C(CO)OC(OC4C(CO)OC(OC5C(O)C(CO)OC(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)C5O)C(NC(C)=O)C4OC4OC(C)C(O)C(O)C4O)C3O)C(NC(C)=O)C2OC2OC(CO)C(O)C(O)C2O)C(O)C(O)C1O INCHI for HMDB0005823 (Difucosyllacto-N-hexaose I)InChI=1S/C52H88N2O39/c1-12-25(66)31(72)34(75)48(80-12)88-40-21(10-60)85-47(24(54-15(4)63)43(40)91-50-36(77)33(74)28(69)18(7-57)82-50)93-45-30(71)20(9-59)84-52(38(45)79)89-41-22(11-61)86-46(23(53-14(3)62)42(41)90-49-35(76)32(73)26(67)13(2)81-49)92-44-29(70)19(8-58)83-51(37(44)78)87-39(17(65)6-56)27(68)16(64)5-55/h5,12-13,16-52,56-61,64-79H,6-11H2,1-4H3,(H,53,62)(H,54,63) 3D Structure for HMDB0005823 (Difucosyllacto-N-hexaose I) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C52H88N2O39 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 1365.2451 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 1364.496421084 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | N-[2-({2-[(6-{[3,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-[(1,2,4,5-tetrahydroxy-6-oxohexan-3-yl)oxy]oxan-4-yl]oxy}-5-acetamido-2-(hydroxymethyl)-4-[(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxy]oxan-3-yl)oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl}oxy)-6-(hydroxymethyl)-4-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-5-[(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxy]oxan-3-yl]acetamide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | N-[2-({2-[(6-{[3,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-[(1,2,4,5-tetrahydroxy-6-oxohexan-3-yl)oxy]oxan-4-yl]oxy}-5-acetamido-2-(hydroxymethyl)-4-[(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxy]oxan-3-yl)oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl}oxy)-6-(hydroxymethyl)-4-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-5-[(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxy]oxan-3-yl]acetamide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 482638-98-2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | CC1OC(OC2C(CO)OC(OC3C(O)C(CO)OC(OC4C(CO)OC(OC5C(O)C(CO)OC(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)C5O)C(NC(C)=O)C4OC4OC(C)C(O)C(O)C4O)C3O)C(NC(C)=O)C2OC2OC(CO)C(O)C(O)C2O)C(O)C(O)C1O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C52H88N2O39/c1-12-25(66)31(72)34(75)48(80-12)88-40-21(10-60)85-47(24(54-15(4)63)43(40)91-50-36(77)33(74)28(69)18(7-57)82-50)93-45-30(71)20(9-59)84-52(38(45)79)89-41-22(11-61)86-46(23(53-14(3)62)42(41)90-49-35(76)32(73)26(67)13(2)81-49)92-44-29(70)19(8-58)83-51(37(44)78)87-39(17(65)6-56)27(68)16(64)5-55/h5,12-13,16-52,56-61,64-79H,6-11H2,1-4H3,(H,53,62)(H,54,63) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | BCUMESVDMXHZRL-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as oligosaccharides. These are carbohydrates made up of 3 to 10 monosaccharide units linked to each other through glycosidic bonds. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Oligosaccharides | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Source
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| Process | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Molecular Properties |
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| Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Molecular Properties |
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| Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
NMR Spectra
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| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB023775 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 4390052 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 5219625 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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