Showing metabocard for Carbon monoxide (HMDB0001361)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2006-08-16 13:51:54 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-02-26 21:23:15 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0001361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Carbon monoxide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Carbon monoxide, with the chemical formula CO, is a colorless, odorless, and tasteless gas. It is the product of the incomplete combustion of carbon-containing compounds, notably in internal-combustion engines. It consists of one carbon atom covalently bonded to one oxygen atom. It is a gas at room temperature. Carbon monoxide is a significantly toxic gas and is the most common type of fatal poisoning in many countries. Exposures can lead to significant toxicity of the central nervous system and heart. Carbon monoxide has a higher diffusion coefficient compared to oxygen and the only enzyme in the human body that produces carbon monoxide is heme oxygenase which is located in all cells and breaks down heme. Because it has a higher diffusion coefficient than oxygen the body easily gets rid of any CO made. When CO is not ventilated it binds to hemoglobin, which is the principal oxygen-carrying compound in blood; this produces a compound known as carboxyhemoglobin. The traditional belief is that carbon monoxide toxicity arises from the formation of carboxyhemoglobin, which decreases the oxygen-carrying capacity of the blood and inhibits the transport, delivery, and utilization of oxygen by the body. The affinity between hemoglobin and carbon monoxide is approximately 230 times stronger than the affinity between hemoglobin and oxygen so hemoglobin binds to carbon monoxide in preference to oxygen. Following poisoning, long-term sequelae often occur. Carbon monoxide can also have severe effects on the fetus of a pregnant woman. Despite its serious toxicity, CO is extremely useful and underpins much modern technology, being a precursor to a myriad of useful - even life-saving - products. Carbon monoxide, though thought of as a pollutant today, has always been present in the atmosphere, chiefly as a product of volcanic activity. It occurs dissolved in molten volcanic rock at high pressures in the earth's mantle. Carbon monoxide contents of volcanic gases vary from less than 0.01% to as much as 2% depending on the volcano. It also occurs naturally in bushfires. Because natural sources of carbon monoxide are so variable from year to year, it is extremely difficult to accurately measure natural emissions of the gas. (wikipedia). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | CO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 28.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 27.99491462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 630-08-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [C-]#[O+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/CO/c1-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | UGFAIRIUMAVXCW-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of inorganic compounds known as homogeneous other non-metal compounds. These are inorganic non-metallic compounds in which the largest atom belongs to the class of 'other non-metals'. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Inorganic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Homogeneous non-metal compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Homogeneous other non-metal compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Homogeneous other non-metal compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Health effect
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Disposition | Biological location
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Process | Naturally occurring process
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Role | Industrial application
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Liquid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesUnderivatized
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GC-MS Spectra
MS/MS Spectra
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations |
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Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References |
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Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | DB11588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB022578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | CARBON-MONOXIDE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | 1749973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Carbon_monoxide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 17245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | CO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Ivanova, Svetlana; Pitchon, Veronique; Petit, Corinne. Application of the direct exchange method in the preparation of gold catalysts supported on different oxide materials. Journal of Molecular Catalysis A: Chemical (2006), 256(1-2), 278-283. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Enzymes
- General function:
- Involved in heme oxygenase (decyclizing) activity
- Specific function:
- Heme oxygenase cleaves the heme ring at the alpha methene bridge to form biliverdin. Biliverdin is subsequently converted to bilirubin by biliverdin reductase. Under physiological conditions, the activity of heme oxygenase is highest in the spleen, where senescent erythrocytes are sequestrated and destroyed. Heme oxygenase 2 could be implicated in the production of carbon monoxide in brain where it could act as a neurotransmitter.
- Gene Name:
- HMOX2
- Uniprot ID:
- P30519
- Molecular weight:
- 36032.615
Reactions
Hemoglobin + FADH + Oxygen → Globin + Biliverdin + Carbon monoxide + Iron + FAD + Water | details |
- General function:
- Involved in heme oxygenase (decyclizing) activity
- Specific function:
- Heme oxygenase cleaves the heme ring at the alpha methene bridge to form biliverdin. Biliverdin is subsequently converted to bilirubin by biliverdin reductase. Under physiological conditions, the activity of heme oxygenase is highest in the spleen, where senescent erythrocytes are sequestrated and destroyed.
- Gene Name:
- HMOX1
- Uniprot ID:
- P09601
- Molecular weight:
- 32818.345
Reactions
Hemoglobin + FADH + Oxygen → Globin + Biliverdin + Carbon monoxide + Iron + FAD + Water | details |
- General function:
- Involved in monooxygenase activity
- Specific function:
- Cytochromes P450 are a group of heme-thiolate monooxygenases. This enzyme requires molecular oxygen and NADPH for the omega-hydroxylation of LTB4, a potent chemoattractant for polymorphonuclear leukocytes.
- Gene Name:
- CYP4F3
- Uniprot ID:
- Q08477
- Molecular weight:
- 59846.085
- General function:
- Involved in ion channel activity
- Specific function:
- Potassium channel activated by both membrane depolarization or increase in cytosolic Ca(2+) that mediates export of K(+). It is also activated by the concentration of cytosolic Mg(2+). Its activation dampens the excitatory events that elevate the cytosolic Ca(2+) concentration and/or depolarize the cell membrane. It therefore contributes to repolarization of the membrane potential. Plays a key role in controlling excitability in a number of systems, such as regulation of the contraction of smooth muscle, the tuning of hair cells in the cochlea, regulation of transmitter release, and innate immunity. In smooth muscles, its activation by high level of Ca(2+), caused by ryanodine receptors in the sarcoplasmic reticulum, regulates the membrane potential. In cochlea cells, its number and kinetic properties partly determine the characteristic frequency of each hair cell and thereby helps to establish a tonotopic map. Kinetics of KCNMA1 channels are determined by alternative splicing, phosphorylation status and its combination with modulating beta subunits. Highly sensitive to both iberiotoxin (IbTx) and charybdotoxin (CTX)
- Gene Name:
- KCNMA1
- Uniprot ID:
- Q12791
- Molecular weight:
- 137558.1
- General function:
- Involved in protein serine/threonine kinase activity
- Specific function:
- Mediates down-regulation of protein synthesis in response to various stress conditions by the phosphorylation of EIF2S1 at 'Ser-48' and 'Ser-51'. Protein synthesis is inhibited at the level of initiation
- Gene Name:
- EIF2AK1
- Uniprot ID:
- Q9BQI3
- Molecular weight:
- 71105.9
- General function:
- Involved in metal ion binding
- Specific function:
- Catalyzes the formation of formate and 2-keto-4-methylthiobutyrate (KMTB) from 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene (DHK-MTPene). Also down-regulates cell migration mediated by MMP14. Necessary for hepatitis C virus replication in an otherwise non-permissive cell line.
- Gene Name:
- ADI1
- Uniprot ID:
- Q9BV57
- Molecular weight:
- 21498.23
Reactions
1,2-Dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene + Oxygen → 3-Methylthiopropionic acid + Formic acid + Carbon monoxide | details |